41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1797 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  44.9 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2702  hypothetical protein  69.39 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00765809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  65.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  55.21 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3604  hypothetical protein  68 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3036  hypothetical protein  60.78 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2797  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2287  protein of unknown function DUF339  48.42 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2200  hypothetical protein  46.81 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521677  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0762  hypothetical protein  50.88 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  50.88 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4644  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2148  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5590  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.678134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3590  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.068021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4365  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3938  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4429  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.731953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3315  hypothetical protein  44 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83082  normal  0.599148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1992  hypothetical protein  45.95 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3831  hypothetical protein  44 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.539928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  41.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1823  protein of unknown function DUF339  41.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0813209  normal  0.601393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2468  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2330  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0664  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0789  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0308696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2321  hypothetical protein  56.25 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2482  hypothetical protein  56.25 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2891  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  41.82 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6852  protein of unknown function DUF339  54.35 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.493884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1745  hypothetical protein  46.55 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0503  TPR repeat-containing protein  46.55 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1833  hypothetical protein  46.55 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0385386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1625  hypothetical protein  46.55 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433858  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  38.46 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  38.18 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  40.82 
 
 		 86 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>