26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0698 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2433  hypothetical protein  68.29 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.776555  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  61.84 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1572  hypothetical protein  55.56 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.667787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1963  hypothetical protein  57.69 
 
 
96 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  55.84 
 
 
88 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  57.32 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2521  hypothetical protein  55 
 
 
83 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0165247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1559  hypothetical protein  50.63 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  44.74 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1932  hypothetical protein  47.14 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4028  hypothetical protein  47.56 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2340  hypothetical protein  43.24 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6525  hypothetical protein  41.67 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  53.49 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0416  hypothetical protein  32.53 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0650663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  36.92 
 
 
84 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1847  acyl carrier protein  32.47 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0417  hypothetical protein  31.33 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  40.43 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3343  acyl carrier protein  32.88 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.812241  hitchhiker  0.00000000000000639555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  31.58 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1841  acyl carrier protein  32.88 
 
 
91 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1984  acyl carrier protein  32.88 
 
 
91 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2019  acyl carrier protein  32.88 
 
 
91 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04545e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1798  acyl carrier protein  32.88 
 
 
91 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>