17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2433 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2433  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.776555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0698  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  64.38 
 
 
88 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1572  hypothetical protein  59.26 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.667787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  55.13 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1963  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  56.58 
 
 
95 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1559  hypothetical protein  56.72 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2521  hypothetical protein  51.25 
 
 
83 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0165247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  49.33 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1932  hypothetical protein  47.37 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4028  hypothetical protein  52.44 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2340  hypothetical protein  43.37 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6525  hypothetical protein  38.57 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519859  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3062  hypothetical protein  37.7 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2333  hitchhiker  0.000664427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4184  hypothetical protein  35.9 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  45.1 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>