30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5676 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 
105 aa  214  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  93.33 
 
 
104 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  93.33 
 
 
104 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  69.52 
 
 
104 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  58 
 
 
146 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  54.81 
 
 
108 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  53 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4860  monooxygenase component MmoB/DmpM  47.19 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111656  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  46.34 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2199  monooxygenase component MmoB/DmpM  38.46 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.031469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  39.76 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0543  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.36 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13468  normal  0.713388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  35.58 
 
 
105 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.9 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  36.59 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  41.1 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0214  monooxygenase component MmoB/DmpM  34.07 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  38.81 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.33 
 
 
89 aa  52  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.17 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  31.71 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.77 
 
 
89 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.33 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.33 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.51 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  26.51 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4808  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.74 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>