23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1701 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  87.64 
 
 
90 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  69.77 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  65.17 
 
 
96 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  63.53 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.65 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  58.33 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 
89 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 
89 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 
89 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.14 
 
 
89 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  55.29 
 
 
89 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  51.69 
 
 
89 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.94 
 
 
89 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.76 
 
 
89 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.38 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  50 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  47.5 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.35 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  34.12 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.47 
 
 
104 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>