16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1454 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 612 aa  1209    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  68.4 
 
 		 610 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  43.61 
 
 		 620 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  42.45 
 
 		 621 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  43.77 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  41.42 
 
 		 636 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  36.72 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  36.77 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 650 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  33.5 
 
 		 644 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 630 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 649 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  25.55 
 
 		 650 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 522 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>