24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3542 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3542  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  400  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.171966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3718  hypothetical protein  88.29 
 
 
208 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0824979  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1158  protein of unknown function DUF1405  54.08 
 
 
215 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.605934  hitchhiker  0.000146418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0858  hypothetical protein  35.42 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.351518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2128  protein of unknown function DUF1405  29.37 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000503182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0491  protein of unknown function DUF1405  26.92 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1249  hypothetical protein  24.58 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1031  hypothetical protein  25.6 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.524701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3764  hypothetical protein  26.89 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1581  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0008  protein of unknown function DUF1405  28.83 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0306436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1407  hypothetical protein  26.89 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1451  hypothetical protein  25.21 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1653  hypothetical protein  26.05 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.865342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1619  hypothetical protein  26.05 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.102076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1548  hypothetical protein  26.05 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.214763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1435  hypothetical protein  26.05 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1549  hypothetical protein  26.17 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0329901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1520  hypothetical protein  26.17 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1691  hypothetical protein  26.85 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.468171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1407  hypothetical protein  25.21 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.361415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1532  protein of unknown function DUF1405  27.11 
 
 
258 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3317  protein of unknown function DUF1405  26.62 
 
 
236 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1246  protein of unknown function DUF1405  26.09 
 
 
243 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>