16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3293 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  61.5 
 
 		 821 aa  983    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1593    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  91.55 
 
 		 778 aa  1442    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1835  hypothetical protein  20.49 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  24.44 
 
 		 808 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2527  hypothetical protein  22.41 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1917  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  26.3 
 
 		 526 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1440  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  24.65 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0137  protein of unknown function DUF324  18.63 
 
 		 757 aa  54.7  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20510  RAMP superfamily protein  25.5 
 
 		 186 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1377  hypothetical protein  32.26 
 
 		 819 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2386  Csx10 family CRISPR-associated RAMP protein  22.74 
 
 		 426 aa  48.9  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0982  hypothetical protein  23.97 
 
 		 408 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1803  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  24.83 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  27.91 
 
 		 214 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>