34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1756 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1756  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15892  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  78.91 
 
 
129 aa  209  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  48.62 
 
 
114 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  41.75 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  27.93 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  31.96 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  35.71 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  33 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  31.96 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  31.71 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  34.12 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  30.68 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  39.29 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  24.47 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  24.47 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  31.65 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  26.51 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  26.83 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  37.21 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1435  protein of unknown function DUF309  36.67 
 
 
193 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  30.49 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  26.14 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  25.29 
 
 
132 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  28.18 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  33.33 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  25.21 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  30.68 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  27.71 
 
 
129 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  31.71 
 
 
180 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  30.91 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  32.43 
 
 
172 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  24.74 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>