27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0194 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  99.78 
 
 		 452 aa  905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  99.78 
 
 		 452 aa  905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  99.12 
 
 		 452 aa  895    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  908    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  908    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  99.78 
 
 		 452 aa  905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  61.44 
 
 		 385 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  57.62 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  56.82 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  57.87 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  32.39 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  32.39 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  32.39 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  32.39 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  32.71 
 
 		 474 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3753  hypothetical protein  61.54 
 
 		 105 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0113248  hitchhiker  0.00544666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  33.33 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  55.36 
 
 		 205 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8496  hypothetical protein  57.78 
 
 		 186 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3752  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00106012  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  25.12 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  25.12 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  27.65 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3218  hypothetical protein  49.41 
 
 		 172 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3298  transposase, IS4  28.5 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0363  hypothetical protein  34.04 
 
 		 119 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  27.05 
 
 		 142 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>