23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0185 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  75.7 
 
 
321 aa  474  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  32.53 
 
 
357 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  36.59 
 
 
339 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  30.43 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  34.35 
 
 
294 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  34.63 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  33.45 
 
 
330 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  29.65 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  26.48 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  29.2 
 
 
712 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  28.92 
 
 
666 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  26.95 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  33.09 
 
 
711 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  27.6 
 
 
699 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  28.97 
 
 
698 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  22.66 
 
 
661 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  28.26 
 
 
719 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  31.74 
 
 
744 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  25 
 
 
289 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  28.21 
 
 
615 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  34.95 
 
 
670 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  28.74 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>