15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2285 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2285  putative signal peptide protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2875  VirK family protein  46.36 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1391  VirK family protein  40.74 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03361  VirK  42.14 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1194  VirK family protein  45.45 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2879  VirK  40.31 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2998  hypothetical protein  42.98 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148355  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1027  VirK protein  37.96 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.242513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0903  VirK family protein  37.04 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.927104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0980  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0891  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1256  hypothetical protein  37.25 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1796  hypothetical protein  27.34 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1795  hypothetical protein  28.06 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2196  hypothetical protein  30.7 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00124751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>