24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1837 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  100 
 
 		 416 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  68.97 
 
 		 413 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  66.58 
 
 		 412 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  66.58 
 
 		 412 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  66.34 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  65.85 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  65.36 
 
 		 412 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  65.11 
 
 		 412 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  61.08 
 
 		 412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  61.39 
 
 		 431 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  56.12 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  51.59 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  47.32 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  46.86 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  41.28 
 
 		 421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  35.97 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  40.36 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  32.2 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  33.97 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  31.88 
 
 		 413 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  26.96 
 
 		 415 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  28.01 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  26.18 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>