36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1742 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1742  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1153  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  71.23 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3696  peptidase C45, acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  68.01 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0468373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1709  peptidase C45, acyl-coenzyme A  59.43 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1141  hypothetical protein  48.32 
 
 		 353 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3495  peptidase C45, acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  47.83 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3978  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  46.95 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230026  normal  0.195489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4501  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  45.93 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1958  peptidase C45, acyl-coenzyme A/6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  46.25 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405511  normal  0.607968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4281  peptidase C45, acyl-coenzyme A  46.15 
 
 		 349 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4085  peptidase C45, acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  46.15 
 
 		 349 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3438  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  45.65 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5219  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  50.48 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33144 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2388  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3155  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3269  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1403  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.771726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1123  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1484  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2095  hypothetical protein  46.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2354  hypothetical protein  49 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5952  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  26.35 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1512  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  28.25 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4727  peptidase C45, acyl-coenzyme A  26.64 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1442  peptidase C45, acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  25.14 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  26.19 
 
 		 3527 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6314  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  27.3 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2647  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  17.59 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06775  acyl-CoA:6-aminopenicillanic-acid- acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12620)  22.36 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0360  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  19.31 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0051  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  25.75 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2859  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  25.98 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0051  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase  26.8 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2635  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  24.42 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1078  peptidase C45 acyl-coenzyme A:6- aminopenicillanic acid acyl-transferase  27.65 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.191196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0804  hypothetical protein  20 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.042243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>