78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0278 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2279  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 603 aa  908    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2975  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  69.87 
 
 		 622 aa  888    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3055  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  61.62 
 
 		 609 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2926  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  71.52 
 
 		 605 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4369  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  61.46 
 
 		 602 aa  763    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0457  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  59.87 
 
 		 623 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3777  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  61.45 
 
 		 609 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.889891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3368  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  63.54 
 
 		 618 aa  788    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2008  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 613 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0398  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 603 aa  908    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0419  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 613 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3087  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 603 aa  908    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1260  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  54.64 
 
 		 589 aa  656    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5989  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  61.06 
 
 		 595 aa  729    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0379  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  72.76 
 
 		 605 aa  908    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28205  normal  0.397547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0128  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  92.14 
 
 		 611 aa  1171    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2941  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  71.52 
 
 		 605 aa  915    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4204  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  60.7 
 
 		 603 aa  766    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000159244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2838  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.68 
 
 		 608 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0180  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  72.2 
 
 		 602 aa  912    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0463  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  72.11 
 
 		 612 aa  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0346  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  71.76 
 
 		 603 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0581  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 603 aa  908    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0136  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  83.39 
 
 		 608 aa  1082    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4733  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  58.67 
 
 		 606 aa  725    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3121  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  54.08 
 
 		 593 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0094  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.94 
 
 		 603 aa  908    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6269  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  70.38 
 
 		 619 aa  910    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3840  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  61.79 
 
 		 615 aa  782    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0278  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  100 
 
 		 608 aa  1259    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.092506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4188  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  62.75 
 
 		 625 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4253  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  73.94 
 
 		 612 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875463  normal  0.269158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0136  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  91.82 
 
 		 611 aa  1169    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0104  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  82.7 
 
 		 607 aa  1065    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2312  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  71.52 
 
 		 605 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2553  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  44.33 
 
 		 589 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0481242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1118  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  42.42 
 
 		 589 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0452  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  44.22 
 
 		 585 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.23077  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0366  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  44.54 
 
 		 612 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0296  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  44.37 
 
 		 575 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3925  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  44.37 
 
 		 575 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0367  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  43.27 
 
 		 585 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4501  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.68 
 
 		 584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.746712  normal  0.0262153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4595  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  42.15 
 
 		 583 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.434751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3777  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  43.13 
 
 		 591 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3956  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  43.15 
 
 		 588 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4397  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  42.15 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4432  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  42.15 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4519  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.81 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00978346  normal  0.188364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4522  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  42.15 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03888  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.87 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4014  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.87 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03848  hypothetical protein  41.87 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5487  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.87 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.959223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4251  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.87 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3981  (Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))) kinase  41.87 
 
 		 578 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4561  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.87 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46450  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.27 
 
 		 577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527502  hitchhiker  0.000135384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4511  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.7 
 
 		 578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4009  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.27 
 
 		 577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4470  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  41.84 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.546627  normal  0.0898843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0220  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  40.82 
 
 		 573 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0917006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1324  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  40.59 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4565  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  40.59 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1792  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  40.14 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1419  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  38.85 
 
 		 573 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4077  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  39.93 
 
 		 569 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3866  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  39.9 
 
 		 569 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.456755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03338  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  37.67 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0758  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  36.96 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1775  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  37.19 
 
 		 575 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2039  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  36.68 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1924  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  36.47 
 
 		 584 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1839  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  37.54 
 
 		 587 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3679  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  35.78 
 
 		 576 aa  349  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0473  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.66 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0350  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  27.18 
 
 		 610 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0377  bifunctional isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase protein  26.89 
 
 		 606 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.653726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>