11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4213 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4213    100 
 
 		 261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  85.22 
 
 		 321 bp  165  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  92.06 
 
 		 1689 bp  85.7  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3735    83.64 
 
 		 579 bp  75.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  87.14 
 
 		 186 bp  67.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1016  hypothetical protein  88.41 
 
 		 375 bp  65.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  90.57 
 
 		 1602 bp  65.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1575 bp  60  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  85.71 
 
 		 1614 bp  60  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4967    90 
 
 		 372 bp  60  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  92.11 
 
 		 450 bp  52  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>