15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1960 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1960    100 
 
 		 519 bp  1029    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0611    98.96 
 
 		 384 bp  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  86.63 
 
 		 402 bp  353  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0610    100 
 
 		 397 bp  242  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1959    100 
 
 		 336 bp  121  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  92.31 
 
 		 354 bp  89.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1435    92 
 
 		 590 bp  67.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  93.02 
 
 		 354 bp  61.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  93.02 
 
 		 354 bp  61.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  94.74 
 
 		 387 bp  60  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    94.74 
 
 		 980 bp  60  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  91.3 
 
 		 354 bp  60  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  90 
 
 		 354 bp  48.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3280  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 		 1191 bp  46.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  100 
 
 		 423 bp  46.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>