54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0903 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  98.89 
 
 		 359 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  100 
 
 		 359 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  56.13 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  57.63 
 
 		 370 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  56.86 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  54.7 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  56.34 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  54.7 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  55.27 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  53.5 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  54.42 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  49.44 
 
 		 363 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  48.15 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  44.38 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  43.26 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  43.79 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  38.87 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  38.14 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  38.19 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  38.72 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  38.48 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  34.89 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  36.67 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  38.91 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  37.19 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  29.27 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  27.64 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  34.12 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  32.95 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  34.58 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  28.97 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  30.92 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  29.71 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  30.35 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  27.65 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  24.4 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  24.91 
 
 		 509 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  26.12 
 
 		 510 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  24.7 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  25.27 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  24.1 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0222  Catalase  26.01 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  23.48 
 
 		 507 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  23.05 
 
 		 488 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.19 
 
 		 529 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  23.05 
 
 		 449 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06020  CAT1 catalase, putative  23.3 
 
 		 701 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  25.62 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>