24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0542 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  97.83 
 
 		 276 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  87.36 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  46.99 
 
 		 288 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  47.04 
 
 		 290 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  51.56 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  51.98 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  45.17 
 
 		 298 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  45.05 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  46.91 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  44.2 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  42.52 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  42.52 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  43.22 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  45.05 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  44.49 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  42.96 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  39.21 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  26.83 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  26.94 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.99 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>