16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03755 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  236  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  78.51 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  69.42 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  69.42 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  69.67 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  67.77 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  67.77 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  68.64 
 
 		 220 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  50.85 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  47.11 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.84 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  39.67 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  39.67 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  27.12 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3164  hypothetical protein  31.62 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00413057  normal  0.13869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>