20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02124 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  87.5 
 
 		 113 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  85.22 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  85.22 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  86.73 
 
 		 113 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  86.73 
 
 		 113 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  72.22 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  74.75 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  66.36 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  77.23 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  60.55 
 
 		 123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  56.6 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  69.81 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  55.96 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  58.95 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  53.92 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  58.72 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  48.67 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  31.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  26.47 
 
 		 111 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>