15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01701 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01701  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3581  XRE family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 245 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4061  helix-turn-helix domain-containing protein  56.79 
 
 		 245 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.859423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1901  XRE family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 246 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4193  XRE family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 245 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4174  XRE family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 245 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383217  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3343  helix-turn-helix domain-containing protein  54.43 
 
 		 245 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1857  XRE family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 245 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01350  transcriptional regulator, XRE family  46.91 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3530  hypothetical protein  33.82 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 245 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 247 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 247 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>