28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00364 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00364  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0509235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3629  hypothetical protein  64.22 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.991909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4706  hypothetical protein  64.22 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060028 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2999  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase  43.36 
 
 		 225 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3945  hypothetical protein  46.23 
 
 		 184 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449838  normal  0.583142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3125  hypothetical protein  43.36 
 
 		 226 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1350  hypothetical protein  43.36 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.718285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3438  hypothetical protein  45.28 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0766715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2037  hypothetical protein  43.09 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4556  hypothetical protein  45.54 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.57288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4334  hypothetical protein  42.99 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00217512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3492  hypothetical protein  42.99 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4032  hypothetical protein  42.99 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0901552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4285  hypothetical protein  41.57 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0614  hypothetical protein  46.58 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0867662 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0039  hypothetical protein  38.2 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4449  hypothetical protein  38.37 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0047  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1476  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0049  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1192  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1546  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0039  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5010  hypothetical protein  36.59 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.833711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3151  hypothetical protein  36.59 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3136  hypothetical protein  37.21 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5295  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>