14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2315 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2315  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  100 
 
 		 130 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2375  putative CobE protein  73.85 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3183  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  63.28 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1883  cobalamin biosynthesis protein G; CbiG  53.08 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3151  putative CobE protein  37.84 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.48 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2217  putative precorrin methylase  38.46 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.06 
 
 		 598 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  32.73 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2924  cobalamin biosynthesis domain-containing protein  38.4 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.736142  normal  0.0157734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.1 
 
 		 547 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.37 
 
 		 354 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.57 
 
 		 368 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0935  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  33.63 
 
 		 350 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>