28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2889 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  63.86 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  66.22 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  52.17 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  59.52 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  62.16 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  78.12 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  68.42 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  45.65 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  77.42 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  42.11 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  82.14 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  77.78 
 
 		 127 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  70.97 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  70.97 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  70.97 
 
 		 139 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  46.25 
 
 		 124 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  80.77 
 
 		 126 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  63.64 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  55.26 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  65.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  37.35 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  67.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  35.37 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  72 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  37.04 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  34.94 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  51.61 
 
 		 124 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>