29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2375 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  76.39 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  75 
 
 		 82 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  73.61 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  68.12 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  60.27 
 
 		 77 aa  95.9  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  61.11 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  67.8 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  59.42 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  55.56 
 
 		 179 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  53.62 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  51.47 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  52.86 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  53.73 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  52.63 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  51.52 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  46.97 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  43.28 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  39.39 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  37.88 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  39.71 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2640  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  28.77 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>