18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2359 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.51473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  77.5 
 
 		 80 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  78.38 
 
 		 78 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3013  hypothetical protein  83.75 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3615  hypothetical protein  69.86 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  56.72 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  50.7 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  47.89 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  46.48 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  53.45 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  47.89 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  47.89 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  41.27 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  40.98 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  39.39 
 
 		 561 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>