16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1387 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1387  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1367  hypothetical protein  87.67 
 
 		 72 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  74.29 
 
 		 70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  77.59 
 
 		 73 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  72.41 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  74 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  67.19 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3028  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  61.54 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  53.19 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2904  hypothetical protein  57.89 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2726  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  52.63 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1363  hypothetical protein  43.24 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3240  hypothetical protein  54.84 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6001  hypothetical protein  40.54 
 
 		 43 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>