18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0521 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0521  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  59.7 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1911  hypothetical protein  53.85 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  46.15 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  45.71 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  42.93 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  42.71 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  42.71 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  39.21 
 
 		 250 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3567  hypothetical protein  47.17 
 
 		 136 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  30.67 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  31.25 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01959  hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6173  hypothetical protein  29.53 
 
 		 591 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  32.67 
 
 		 451 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0325  hypothetical protein  23.16 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000884213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>