60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0187 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0185  hypothetical protein  65.96 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2391  protein of unknown function DUF1427  77.89 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.611497  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3973  hypothetical protein  57.89 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1275  hypothetical protein  62.89 
 
 		 101 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1303  hypothetical protein  65.43 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1557  hypothetical protein  68.75 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1269  hypothetical protein  65.43 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4535  hypothetical protein  61.18 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.132762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1370  hypothetical protein  61.18 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1392  hypothetical protein  60 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0910  hypothetical protein  60 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5595  hypothetical protein  73.17 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132821  normal  0.221611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5595  hypothetical protein  66.23 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5811  hypothetical protein  64.94 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500671  normal  0.64803 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6341  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1488  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7007  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00199598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1667  protein of unknown function DUF1427  63.41 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0124923  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0688  hypothetical protein  53.19 
 
 		 193 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1986  hypothetical protein  53.19 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0597  hypothetical protein  53.19 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0241  hypothetical protein  53.61 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4850  hypothetical protein  48.91 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318855  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5316  hypothetical protein  52.13 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000182463  normal  0.526601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29250  hypothetical protein  65.48 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3972  hypothetical protein  66.67 
 
 		 93 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187282  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5471  protein of unknown function DUF1427  60.53 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313768  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5593  hypothetical protein  69.81 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5809  hypothetical protein  69.81 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385618  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4096  hypothetical protein  59.26 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1234  hypothetical protein  64.71 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248171 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7009  hypothetical protein  64.15 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467067 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6343  hypothetical protein  64.15 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1486  hypothetical protein  64.15 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4655  hypothetical protein  64 
 
 		 57 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1395  hypothetical protein  60.78 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1373  hypothetical protein  60.78 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0401541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0913  hypothetical protein  60.78 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4538  hypothetical protein  60.78 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5724  hypothetical protein  46.05 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4952  hypothetical protein  61.7 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539858  normal  0.852246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1272  hypothetical protein  63.04 
 
 		 55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1306  hypothetical protein  63.04 
 
 		 55 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.213895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6129  protein of unknown function DUF1427  57.45 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3579  hypothetical protein  63.83 
 
 		 50 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2385  hypothetical protein  48.48 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0463  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0489  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2616  hypothetical protein  61.7 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0187943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3760  hypothetical protein  66.04 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7120  protein of unknown function DUF1427  62.96 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0238  hypothetical protein  56.36 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53100  hypothetical protein  62 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1915  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  48.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782929  normal  0.478808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6338  hypothetical protein  51.11 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1491  hypothetical protein  51.11 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7004  hypothetical protein  48.89 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3141  protein of unknown function DUF1427  68.97 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3503  hypothetical protein  67.86 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0476424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>