58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5593 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5809  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385618  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5593  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6343  hypothetical protein  89.09 
 
 		 55 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1486  hypothetical protein  89.09 
 
 		 55 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7009  hypothetical protein  87.27 
 
 		 55 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1373  hypothetical protein  70.91 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0401541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1395  hypothetical protein  69.09 
 
 		 55 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0913  hypothetical protein  69.09 
 
 		 55 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4538  hypothetical protein  69.09 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0241  hypothetical protein  68.52 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1272  hypothetical protein  67.27 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1306  hypothetical protein  67.27 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.213895 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3973  hypothetical protein  69.81 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5595  hypothetical protein  67.92 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132821  normal  0.221611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5316  hypothetical protein  64.15 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000182463  normal  0.526601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0187  hypothetical protein  69.81 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1275  hypothetical protein  69.23 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4850  hypothetical protein  62.26 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1667  protein of unknown function DUF1427  62.96 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0124923  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1557  hypothetical protein  64.15 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0185  hypothetical protein  64.15 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427004 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1234  hypothetical protein  62.26 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0910  hypothetical protein  62.26 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1392  hypothetical protein  62.26 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4096  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1269  hypothetical protein  60.38 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4952  hypothetical protein  58.33 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539858  normal  0.852246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0688  hypothetical protein  61.11 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1370  hypothetical protein  60.38 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1986  hypothetical protein  61.11 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4535  hypothetical protein  58.49 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.132762 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0597  hypothetical protein  61.11 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5724  hypothetical protein  58 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1303  hypothetical protein  58.49 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109752 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7007  hypothetical protein  56.6 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6341  hypothetical protein  56.6 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1488  hypothetical protein  56.6 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4655  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2385  hypothetical protein  59.57 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6129  protein of unknown function DUF1427  57.45 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3579  hypothetical protein  58 
 
 		 50 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0489  hypothetical protein  56 
 
 		 50 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0463  hypothetical protein  56 
 
 		 50 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5595  hypothetical protein  52.83 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2616  hypothetical protein  57.45 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0187943  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5811  hypothetical protein  50.94 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500671  normal  0.64803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3972  hypothetical protein  64.81 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29250  hypothetical protein  64.81 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2391  protein of unknown function DUF1427  65.79 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.611497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1491  hypothetical protein  47.73 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6338  hypothetical protein  47.73 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5471  protein of unknown function DUF1427  62.26 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313768  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7004  hypothetical protein  46.67 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53100  hypothetical protein  58 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3760  hypothetical protein  64 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7120  protein of unknown function DUF1427  52.73 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0238  hypothetical protein  56.25 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3141  protein of unknown function DUF1427  65.62 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>