44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1491 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6338  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1491  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7004  hypothetical protein  84.62 
 
 
78 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5724  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335581  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6129  protein of unknown function DUF1427  60.32 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2385  hypothetical protein  55.88 
 
 
80 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435678  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4952  hypothetical protein  55.41 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539858  normal  0.852246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4096  hypothetical protein  58.7 
 
 
58 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3973  hypothetical protein  56.52 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5595  hypothetical protein  55.56 
 
 
95 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132821  normal  0.221611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1667  protein of unknown function DUF1427  55.56 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0124923  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0913  hypothetical protein  53.85 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1395  hypothetical protein  53.85 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0241  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5316  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000182463  normal  0.526601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1373  hypothetical protein  51.92 
 
 
55 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0401541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2616  hypothetical protein  52.08 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0187943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0463  hypothetical protein  52.08 
 
 
50 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0489  hypothetical protein  52.08 
 
 
50 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4538  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1275  hypothetical protein  36.99 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3579  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7009  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0467067 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6343  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913024  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0187  hypothetical protein  51.11 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1486  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5809  hypothetical protein  47.73 
 
 
55 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385618  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5593  hypothetical protein  47.73 
 
 
55 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246716  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0185  hypothetical protein  36.11 
 
 
96 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4850  hypothetical protein  45.65 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1557  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.726683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0238  hypothetical protein  59.57 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4655  hypothetical protein  48.94 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7120  protein of unknown function DUF1427  57.45 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7007  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1488  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6341  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1306  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.213895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1272  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1234  hypothetical protein  45.65 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.248171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0597  hypothetical protein  40.32 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0688  hypothetical protein  40.32 
 
 
193 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5595  hypothetical protein  48.89 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324913  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1986  hypothetical protein  40.32 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>