52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3503 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3503  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0476424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3141  protein of unknown function DUF1427  60.61 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3579  hypothetical protein  65.96 
 
 		 50 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0688  hypothetical protein  70 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0489  hypothetical protein  63.83 
 
 		 50 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2616  hypothetical protein  63.83 
 
 		 49 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0187943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0463  hypothetical protein  63.83 
 
 		 50 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1986  hypothetical protein  70 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0597  hypothetical protein  70 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4535  hypothetical protein  57.89 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.132762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2385  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4096  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1370  hypothetical protein  54.39 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1269  hypothetical protein  67.44 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1234  hypothetical protein  55.1 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0910  hypothetical protein  54.39 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1392  hypothetical protein  54.39 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0241  hypothetical protein  65.12 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1303  hypothetical protein  65.12 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109752 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3973  hypothetical protein  61.7 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0187  hypothetical protein  52.17 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0185  hypothetical protein  62.5 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1667  protein of unknown function DUF1427  70 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0124923  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5593  hypothetical protein  60 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6129  protein of unknown function DUF1427  43.66 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4850  hypothetical protein  57.45 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318855  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5809  hypothetical protein  60 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385618  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1557  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6341  hypothetical protein  60.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1488  hypothetical protein  60.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7007  hypothetical protein  60.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4952  hypothetical protein  52.08 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539858  normal  0.852246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5595  hypothetical protein  59.62 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132821  normal  0.221611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5316  hypothetical protein  55.32 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000182463  normal  0.526601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1486  hypothetical protein  64.29 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6343  hypothetical protein  64.29 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7009  hypothetical protein  64.29 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4655  hypothetical protein  53.45 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5595  hypothetical protein  58.14 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.324913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1275  hypothetical protein  62.5 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1272  hypothetical protein  50.91 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1306  hypothetical protein  50.91 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.213895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5724  hypothetical protein  51.02 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5811  hypothetical protein  55.81 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500671  normal  0.64803 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1395  hypothetical protein  49.09 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0913  hypothetical protein  49.09 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4538  hypothetical protein  49.09 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1373  hypothetical protein  49.09 
 
 		 55 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0401541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5471  protein of unknown function DUF1427  62.5 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2391  protein of unknown function DUF1427  57.5 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.611497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53100  hypothetical protein  51.72 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1915  hypothetical protein  44.23 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782929  normal  0.478808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>