16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4991 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4991  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1072  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3554  hypothetical protein  46.3 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312649  normal  0.914375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2935  hypothetical protein  39.81 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2644  hypothetical protein  41.86 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0462  hypothetical protein  41.86 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0440  hypothetical protein  41.86 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0394  hypothetical protein  43.02 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0397  hypothetical protein  39.77 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0376  hypothetical protein  35.51 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0373  hypothetical protein  43.04 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0143  hypothetical protein  38.1 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1086  hypothetical protein  31.13 
 
 
106 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0159  hypothetical protein  36.51 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0148  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0143  hypothetical protein  36.07 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>