More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1773 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4103  phosphate transporter  74.16 
 
 
538 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348099  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3676  phosphate transporter  75.67 
 
 
538 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151212  hitchhiker  0.00000639982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3702  phosphate transporter family protein  96.28 
 
 
484 aa  943    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1773  phosphate transporter  100 
 
 
538 aa  1081    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475806  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4319  phosphate transporter  79.66 
 
 
537 aa  864    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2559  phosphate transporter  68.54 
 
 
536 aa  685    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.768412  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1668  phosphate transporter  65.41 
 
 
540 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.336875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0552  putative phosphate transporter  79 
 
 
536 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2657  inorganic phosphate transporter  69.34 
 
 
542 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3854  phosphate transporter  63.39 
 
 
529 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1761  phosphate transporter  73.98 
 
 
538 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04880  Phosphate transporter  75.56 
 
 
536 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05870  putative phosphate transporter  78.7 
 
 
540 aa  854    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.996994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0274  phosphate transporter  65.28 
 
 
534 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951775  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1637  phosphate transporter  66.14 
 
 
539 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265126  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2689  phosphate transporter  68.95 
 
 
546 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2029  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
528 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0709  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
528 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0613  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
528 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3432  phosphate transporter  59.96 
 
 
544 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0245217  normal  0.231604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2121  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
528 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2208  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
528 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.757922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1572  phosphate transporter family protein  65.55 
 
 
494 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4651  phosphate transporter  61.34 
 
 
530 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4305  phosphate transporter  62.79 
 
 
528 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.323368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5180  phosphate transporter  61.54 
 
 
530 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0357  phosphate transporter  61.05 
 
 
530 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.763168 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0807  phosphate transporter family protein  64.3 
 
 
528 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.65234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0970  phosphate transporter  59.89 
 
 
529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1005  phosphate transporter family protein  62.94 
 
 
543 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4977  phosphate transporter  62.65 
 
 
530 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3076  phosphate transporter  62.65 
 
 
530 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3244  phosphate transporter  61.57 
 
 
528 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5291  phosphate transporter  62.65 
 
 
530 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5327  phosphate transporter  60.27 
 
 
534 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5255  phosphate transporter  63.62 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4788  phosphate transporter  63.4 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3178  phosphate transporter  60.51 
 
 
533 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0323756  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3469  phosphate transporter  59.92 
 
 
533 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.866739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3866  phosphate transporter  59.06 
 
 
542 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5331  phosphate transporter  58.58 
 
 
551 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1071  phosphate transporter  55.27 
 
 
497 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.454735  hitchhiker  0.000185026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4732  phosphate transporter  48.23 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.84748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4985  phosphate transporter  47.81 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4312  phosphate transporter family protein  45.68 
 
 
490 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10600  Phosphate transporter  46.34 
 
 
492 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1373  phosphate transporter  46.15 
 
 
490 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4016  phosphate transporter  45.47 
 
 
490 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4350  phosphate transporter  46.15 
 
 
497 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4441  phosphate transporter  45.75 
 
 
497 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375988  hitchhiker  0.000123098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1262  phosphate transporter  45.62 
 
 
491 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55770  putative phosphate transporter  46.09 
 
 
489 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3045  phosphate transporter  43.72 
 
 
489 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330688  normal  0.118917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4859  putative phosphate transporter  46.54 
 
 
489 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3484  phosphate transporter  43.63 
 
 
489 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0878  phosphate transporter  43.63 
 
 
489 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0927  phosphate transporter  43.31 
 
 
489 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3409  phosphate transporter  43.01 
 
 
494 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0892  phosphate transporter  43.31 
 
 
489 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170136  normal  0.621096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  43.31 
 
 
489 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3607  phosphate transporter  43.42 
 
 
489 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.309683  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4689  phosphate transporter  42.54 
 
 
500 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4203  phosphate transporter  42.38 
 
 
501 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1013  phosphate transporter  46.15 
 
 
490 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3907  phosphate transporter  43.39 
 
 
499 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3782  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.98 
 
 
499 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3829  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.98 
 
 
499 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3930  phosphate transporter  42.57 
 
 
504 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03342  phosphate transporter, low-affinity  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0222  phosphate transporter  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0223  phosphate transporter  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3692  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3975  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4839  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03295  hypothetical protein  42.98 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3272  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.53 
 
 
499 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02863  phosphate transporter  42.32 
 
 
499 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0706  phosphate transporter  42.32 
 
 
499 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720208  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02812  hypothetical protein  42.32 
 
 
499 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3454  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.12 
 
 
499 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3167  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.12 
 
 
499 aa  362  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4486  phosphate transporter  42.46 
 
 
501 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0709  phosphate transporter  42.12 
 
 
499 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3902  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.47 
 
 
498 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3792  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.47 
 
 
498 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3782  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.47 
 
 
498 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.675569  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3963  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.47 
 
 
498 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3859  putative low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.47 
 
 
498 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0686997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0122  phosphate transporter  41.49 
 
 
531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4033  low-affinity inorganic phosphate transporter  41.36 
 
 
498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4117  phosphate transporter  42.09 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4093  phosphate transporter  41.36 
 
 
498 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3020  phosphate transporter  42.62 
 
 
489 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2692  phosphate transporter  41.91 
 
 
451 aa  352  8e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.608667  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0055  low-affinity inorganic phosphate transporter  40.41 
 
 
524 aa  343  5.999999999999999e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4299  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  38.64 
 
 
438 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0331  phosphate transporter  65.82 
 
 
160 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0184  putative phosphate permease  40.65 
 
 
363 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  38.68 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  38.68 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>