11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1089 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1269  hypothetical protein  77.78 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0987  hypothetical protein  53.42 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0984  hypothetical protein  47.86 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0978  hypothetical protein  45.65 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4239  hypothetical protein  47.06 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1016  hypothetical protein  45.65 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3529  hypothetical protein  40.76 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00257659  normal  0.365119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1280  hypothetical protein  41.98 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14450  hypothetical protein  42.36 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11630  hypothetical protein  34.72 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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