36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0615 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  83.33 
 
 		 240 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  31.22 
 
 		 241 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 		 494 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  30.46 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 504 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  29.39 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  31.36 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  29.69 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  29.44 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  22.47 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  23.18 
 
 		 548 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  21.25 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  24.11 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  25.47 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  23.02 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  29.5 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  24.4 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  22.91 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  24.06 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.43 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  21.21 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  22.01 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.71 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2893  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.04 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.413887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.04 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00238421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  20.29 
 
 		 326 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.52 
 
 		 355 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.22 
 
 		 325 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>