22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1114 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  65.75 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  63.01 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  65.75 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  62.16 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  65.45 
 
 		 55 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  49.23 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  40.58 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  47.46 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  50.85 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  47.37 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  36.07 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  34.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  36.36 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  35.59 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  32.88 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2157  hypothetical protein  32.31 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109141  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  32.2 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>