66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0289 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0289  chorismate lyase  100 
 
 		 168 aa  343  8e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0317  chorismate lyase  83.93 
 
 		 168 aa  280  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2084  chorismate lyase  66.67 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.133367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6134  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3954  Chorismate lyase  30.32 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5520  chorismate pyruvate lyase  30.32 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3594  chorismate lyase  40 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03911  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4279  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4592  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3989  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4501  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4558  chorismate pyruvate lyase  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03871  hypothetical protein  31.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0678  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3864  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3774  chorismate pyruvate lyase  30.77 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0658  chorismate lyase  31.25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0243  chorismate pyruvate lyase  30.34 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0729  chorismate pyruvate lyase  31.62 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70720  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4464  chorismate pyruvate lyase  30.22 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1335  chorismate--pyruvate lyase, putative  36.79 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0510  chorismate pyruvate lyase  31.21 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3402  Chorismate lyase  36.67 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.750194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4425  chorismate pyruvate lyase  35.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4627  chorismate pyruvate lyase  35.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4576  chorismate pyruvate lyase  35.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464602  normal  0.0352552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4490  chorismate pyruvate lyase  35.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.232618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4575  chorismate pyruvate lyase  35.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  30.82 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  30.82 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  30.77 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  30.82 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0125  putative chorismate--pyruvate lyase  29.63 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2439  chorismate lyase  31.14 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0971  chorismate pyruvate lyase  26.97 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00931015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  31.29 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5030  chorismate lyase  26.99 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3528  Chorismate lyase  35.56 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5603  chorismate lyase  29.09 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1221  Chorismate lyase  27.01 
 
 		 227 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4826  chorismate lyase  31.13 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4398  chorismate lyase  28.29 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4431  chorismate lyase  29.25 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000175928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0966  chorismate lyase  31.03 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0938345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  25.3 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4410  chorismate lyase  28.39 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0608691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3325  chorismate lyase  27.01 
 
 		 227 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  29.41 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  29.06 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0126  chorismate lyase  29.25 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2896  chorismate--pyruvate lyase  28.89 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0150  chorismate lyase  31.69 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5685  chorismate lyase  27.73 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1734  chorismate lyase  26.96 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2262  chorismate lyase  26.61 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2367  chorismate lyase  28.45 
 
 		 198 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5475  chorismate-pyruvate lyase, putative  26.25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2346  chorismate lyase  26.96 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2382  chorismate lyase  26.61 
 
 		 197 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2111  chorismate lyase  25.64 
 
 		 230 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0933  chorismate lyase  26.83 
 
 		 204 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3623  putative chorismate--pyruvate lyase  28.93 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0141  putative chorismate--pyruvate lyase  25.23 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2049  chorismate--pyruvate lyase  25.23 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>