298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_R0018 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0018  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00000502175 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0070  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0060  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.873791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  232  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0023  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.7425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0048  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.926696  normal  0.0497776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0056  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 		 114 bp  210  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0061  5S ribosomal RNA  98.25 
 
 		 114 bp  210  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0159471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0046  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 114 bp  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0054  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 114 bp  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0163881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0059  5S ribosomal RNA  96.49 
 
 		 114 bp  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0022  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 102 bp  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0034  5S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0041  5S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0049  5S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 115 bp  93.7  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 		 115 bp  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 		 120 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4842  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0815  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6149  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.989968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5399  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 120 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0966302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08610  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 132 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55620  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 132 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.431806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62050  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 132 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70870  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 132 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 121 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 120 bp  81.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0078  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0012  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34851  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0070  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r03  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r06  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r09  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r10  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 115 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0038  5S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 120 bp  79.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988118  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55050  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55080  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA17  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA48  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA70  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA78  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA79  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA8  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55090  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55120  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55020  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55150  5S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 118 bp  77.8  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr03  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr06  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr07  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr03  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr06  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr07  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0095  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0009  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0009  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.000000221219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0130  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360206  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0146  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.163233  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0157  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884697  normal  0.0459109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0006  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 116 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.166515  hitchhiker  0.0000000146471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0012  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.486509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0003  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0151  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0163  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0141  5S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 115 bp  73.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 113 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
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NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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