92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3272 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  98.66 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  99.33 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  93.65 
 
 		 299 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  76.92 
 
 		 299 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  65.99 
 
 		 298 aa  427  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  67.36 
 
 		 299 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  69.36 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  69.36 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  61.09 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  58.05 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.19 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.52 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.19 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.19 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  56.75 
 
 		 301 aa  363  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  55.85 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  55.18 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  53.85 
 
 		 300 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  53.51 
 
 		 300 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  54.18 
 
 		 300 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  56.04 
 
 		 315 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  56.04 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  56.04 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  56.04 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  56.04 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  56.04 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.51 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  55.78 
 
 		 300 aa  351  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  55.93 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  55.93 
 
 		 301 aa  349  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  54.67 
 
 		 304 aa  348  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  58.55 
 
 		 302 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  58.55 
 
 		 302 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  58.55 
 
 		 302 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  58.55 
 
 		 302 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  58.55 
 
 		 302 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  52.72 
 
 		 302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  54.74 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.84 
 
 		 304 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  56.18 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  55.94 
 
 		 304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  55.59 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.15 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.85 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  48.84 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  49.17 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  49.5 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.5 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.16 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.46 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  52.69 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.5 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.31 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  35.23 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  31.98 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  31.98 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.52 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35.5 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.24 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.32 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0306  hypothetical protein  29.74 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.497048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  29.95 
 
 		 255 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.96 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2038  hypothetical protein  27.69 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1745  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.64 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.64 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.64 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.25 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.47 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.25 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.19 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.02 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  24.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  24.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  24.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  24.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  24.12 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  25.58 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.15 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.98 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  25 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  25.12 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44505  predicted protein  35.4 
 
 		 521 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.75 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  25.13 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.08 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  26.4 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02817  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.62 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  25.21 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  29.13 
 
 		 404 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>