171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4525 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4525  IS256 family transposase  100 
 
 
64 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  96.88 
 
 
398 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  64.52 
 
 
398 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  64.52 
 
 
398 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  64.52 
 
 
398 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  64.52 
 
 
398 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  64.52 
 
 
398 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  65 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  65 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  65 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  62.9 
 
 
399 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  62.9 
 
 
399 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  66.07 
 
 
399 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  60.32 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  60.32 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  55.56 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  61.67 
 
 
399 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  61.67 
 
 
399 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  61.67 
 
 
399 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  61.67 
 
 
399 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  63.46 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  71.74 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  71.74 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  71.74 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  68.09 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  53.23 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  54.39 
 
 
419 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  54.39 
 
 
419 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  54.39 
 
 
419 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  54.1 
 
 
411 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  63.83 
 
 
402 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  53.23 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  55.17 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  53.45 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  53.45 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  53.45 
 
 
428 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2875  hypothetical protein  53.23 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.302821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  62.5 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  53.23 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  62.5 
 
 
417 aa  63.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  53.23 
 
 
413 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  53.23 
 
 
413 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>