11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3896 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4586  hypothetical protein  87.03 
 
 		 402 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.795703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1302  hypothetical protein  87.53 
 
 		 402 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4116  hypothetical protein  87.31 
 
 		 402 aa  720    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1393  hypothetical protein  64.2 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1777  hypothetical protein  56.38 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.909044  normal  0.825456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32920  hypothetical protein  57.71 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2660  ribosomal protein L31  37.27 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  31.43 
 
 		 612 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  30.48 
 
 		 623 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  30.48 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>