48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2949 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2471  hypothetical protein  72.44 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2303  hypothetical protein  73.76 
 
 		 225 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.754435  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0758  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.81 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1707  hypothetical protein  43.69 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2971  hypothetical protein  40.27 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 		 577 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.49 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.66 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.62 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 		 423 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.75 
 
 		 615 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.84 
 
 		 601 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 		 615 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.79 
 
 		 413 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 		 429 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3034  hypothetical protein  29.47 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1593  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.53 
 
 		 396 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0714  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 		 683 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  24.66 
 
 		 399 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 		 640 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.27 
 
 		 688 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.59 
 
 		 557 aa  48.5  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 		 797 aa  48.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 		 635 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 		 589 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 		 589 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.75 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.2 
 
 		 597 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.62 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1518  hypothetical protein  19.14 
 
 		 328 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.62 
 
 		 449 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 		 417 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  25.95 
 
 		 533 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.76 
 
 		 541 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0950  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.1 
 
 		 517 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.943856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.08 
 
 		 487 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3447  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.95 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  32.52 
 
 		 577 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 		 689 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  29.52 
 
 		 677 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  29.52 
 
 		 794 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 445 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 		 669 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 		 396 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>