21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2465 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  91.11 
 
 		 180 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  86.67 
 
 		 180 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  85.56 
 
 		 180 aa  299  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  57.46 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  58.12 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  37.02 
 
 		 201 aa  94.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  34.09 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  34.97 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  32.92 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  37.63 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  38.1 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  39.13 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  30.97 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  28.71 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  25.55 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  27.08 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2418  fimbrial assembly family protein  26.52 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1436  hypothetical protein  30.17 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0317201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>