12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0505 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0505  lipoprotein  100 
 
 		 109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5010  lipoprotein  87.16 
 
 		 109 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4961  putative lipoprotein  86.24 
 
 		 109 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4834  hypothetical protein  86.24 
 
 		 109 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5263  putative lipoprotein  69.72 
 
 		 110 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0461  hypothetical protein  71.26 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4788  putative lipoprotein  59.09 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0994885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0389  lipoprotein, putative  58.18 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07210  hypothetical protein  57.5 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0657  hypothetical protein  57.5 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  34.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  37.84 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>