15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5306 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5306  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5164  hypothetical protein  92.16 
 
 		 102 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23504  normal  0.0982881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5254  hypothetical protein  90.2 
 
 		 112 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  86.25 
 
 		 188 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 208 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  43.42 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  49.28 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  31.46 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 325 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>