12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4116 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4586  hypothetical protein  94.53 
 
 		 402 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.795703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1302  hypothetical protein  95.26 
 
 		 402 aa  757    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3896  hypothetical protein  87.31 
 
 		 402 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1393  hypothetical protein  63.84 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1777  hypothetical protein  57.91 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.909044  normal  0.825456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32920  hypothetical protein  58.63 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2660  ribosomal protein L31  37.1 
 
 		 429 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  31.43 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  30.48 
 
 		 623 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  30.48 
 
 		 623 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  30.19 
 
 		 689 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>