22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3173 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3727  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  38.36 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  32.88 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  40.74 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  42.59 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  35.21 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  32.31 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  40.74 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  37.04 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  32 
 
 		 81 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  35.19 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  32.76 
 
 		 79 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>