73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2471 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2303  hypothetical protein  88.39 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.754435  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2949  hypothetical protein  72.44 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0758  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.98 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1707  hypothetical protein  41.96 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2971  hypothetical protein  39.65 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.01 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3034  hypothetical protein  34.44 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.34 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.65 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.65 
 
 		 453 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1593  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.46 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1518  hypothetical protein  20.1 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.87 
 
 		 1054 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  25.95 
 
 		 576 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0950  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.1 
 
 		 517 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.943856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 		 615 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.54 
 
 		 601 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.63 
 
 		 688 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8518  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 		 400 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  normal  0.0186801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.81 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  30.17 
 
 		 399 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1683  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.33 
 
 		 559 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0714  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  27.65 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.66 
 
 		 797 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 		 540 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0653  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 360 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 		 597 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  41.79 
 
 		 577 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2583  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.87 
 
 		 450 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00536309  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0689  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.41 
 
 		 464 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 315 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  25.15 
 
 		 485 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.2 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.38 
 
 		 433 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7880  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 		 341 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.0136803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 		 397 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7060  hypothetical protein  28.51 
 
 		 350 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3447  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.12 
 
 		 396 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 689 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.45 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  28.82 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  21.33 
 
 		 495 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 		 557 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.06 
 
 		 615 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00214  serine protease  29.66 
 
 		 441 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  28.24 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0567  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 		 465 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0103746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 		 1052 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3756  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 		 601 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.652103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2671  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 		 479 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 		 431 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2376  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 		 462 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.77 
 
 		 445 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.08 
 
 		 440 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.71 
 
 		 669 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 		 635 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 		 425 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.180184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>